Magyarország második legnagyobb légikikötője a Debreceni Nemzetközi Repülőtér (DEB), melyet a közelmúltban bővítettek ki azért, hogy több nemzetközi járatot is képes legyen fogadni. A légikikötő a városközponttól 5 kilométerre délnyugatra található, és viszonylag könnyen elérhető Szlovákia, Erdély és Ukrajna közeli régióiból is. A reptér - mely 2014-ben 145 ezer utast szolgált ki - szezonális chartereket, illetve a Wizz Air menetrend szerinti fapados járatait indítja, illetve fogadja. A debreceni repülőtérről a Bulgarian Air Charter (Burgasz), a Freebird Airlines (Antalya), a Germania (Drezda, Erfurt, Lipcse), a Fly Egypt (Hurghada), a Smart Wings és a Travel Service Hungary (Antalya, Korfu, Heraklion), valamint 2015 októberétől és decemberétől a Wizz Air (Bergamo, Eindhoven, London-Luton, Malmö, Beauvais, Brüsszel-Charleroi) járataira vásárolhatunk repülőjegyet.
Debrecen belvárosából, a Debreceni Egyetemtől repülőtéri autóbuszjárattal lehet elérni a légikikötőt, mely minden jelentősebb csomópontot érint, a viteldíj 500 forint, ezen kívül taxival (fix tarifák), valamint a DKV airport shuttle buszaival is elérhető a repülőtér, vagy onnan a városközpont. A legközelebbi nemzetközi reptér a nagyváradi, mely 1 óra 20 perc alatt elérhető Debrecenből.